Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms