Protein–RNA interactions for Protein: A1Y9I9

Tomt, Transmembrane O-methyltransferase homolog, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TomtA1Y9I9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TomtA1Y9I9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms