Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Homer1Q9Z2Y3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms