Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdpk1Q9Z2A0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms