Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms