Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn9Q9Z0S7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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