Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp1a4Q9WV27 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms