Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms