Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChmlQ9QZD5 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms