Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms