Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms