Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Trim44Q9QXA7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim44Q9QXA7 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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