Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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