Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rabgef1Q9JM13 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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