Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nectin3Q9JLB9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms