Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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CubnQ9JLB4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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CubnQ9JLB4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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CubnQ9JLB4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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CubnQ9JLB4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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CubnQ9JLB4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms