Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL16

Isg20, Interferon-stimulated gene 20 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Isg20Q9JL16 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Isg20Q9JL16 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms