Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Upk3aQ9JKX8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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