Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ybx3Q9JKB3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms