Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmbr1Q9JIT0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms