Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms