Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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