Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Slc28a3Q9ERH8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Slc28a3Q9ERH8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms