Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhox9Q9EQM5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms