Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Tlr1Q9EPQ1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Tlr1Q9EPQ1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms