Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smco2Q9DA21 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms