Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmigd1Q9D7L8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmigd1Q9D7L8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms