Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf225Q9D7D1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm45114-201ENSMUST00000208280 1349 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf225Q9D7D1 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms