Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tube1Q9D6T1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tube1Q9D6T1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tube1Q9D6T1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tube1Q9D6T1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tube1Q9D6T1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tube1Q9D6T1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tube1Q9D6T1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms