Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krt34Q9D646 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms