Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3404Q9D506 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm3404Q9D506 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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