Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms