Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Rpl31-201ENSMUST00000086535 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ms4a4cQ9D3F6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Gm8048-201ENSMUST00000182555 996 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Gm43693-201ENSMUST00000196072 1249 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Gm2788-205ENSMUST00000209849 933 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Cd40lg-201ENSMUST00000033466 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Cypt2-201ENSMUST00000041758 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 4930448K20Rik-202ENSMUST00000182072 1433 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Tmigd1-201ENSMUST00000072633 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ms4a4cQ9D3F6 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms