Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef12Q9D2F1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef12Q9D2F1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef12Q9D2F1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef12Q9D2F1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Pramef12Q9D2F1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pramef12Q9D2F1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Pramef12Q9D2F1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Pramef12Q9D2F1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Pramef12Q9D2F1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Pramef12Q9D2F1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pramef12Q9D2F1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pramef12Q9D2F1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef12Q9D2F1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pramef12Q9D2F1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pramef12Q9D2F1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef12Q9D2F1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef12Q9D2F1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef12Q9D2F1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pramef12Q9D2F1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pramef12Q9D2F1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef12Q9D2F1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef12Q9D2F1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef12Q9D2F1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef12Q9D2F1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef12Q9D2F1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef12Q9D2F1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef12Q9D2F1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef12Q9D2F1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef12Q9D2F1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pramef12Q9D2F1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pramef12Q9D2F1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms