Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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