Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms