Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms