Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms