Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gtf2e1Q9D0D5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms