Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc47Q9D024 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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