Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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