Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Atg12Q9CQY1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Atg12Q9CQY1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms