Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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