Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Tmed6Q9CQG0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed6Q9CQG0 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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