Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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