Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms