Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brms1Q99N20 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms