Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Hdac9Q99N13 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Hdac9Q99N13 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms