Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms