Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS4

Prss29, Serine protease 29, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss29Q99MS4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Prss29Q99MS4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms